Вчені вперше виявили вірус Зіка в тканинах головного мозку ембріона, ураженого мікроцефалією. Це стало одним з перших переконливих свідчень того, що лихоманка Зіка викликає мікроцефалію у новонароджених. Результати дослідження були опубліковані в .У жовтні 2015 року у відділення перинатології медичного центру в Словенії звернулася 25-річна вагітна жінка, біля плоду якої підозрювалися вади розвитку. До цього вона працювала в Бразилії, де на 13 тижні вагітності важко захворіла. У пацієнтки підозрювалася лихоманка Зіка, проте вірусологічне обстеження не проводилося, а наступні УЗД не виявили жодних патологій у розвитку плоду - аж до 29 тижня, коли з'явилися перші ознаки порушень. Ультразвукове обстеження, яке проводилося на 32 тижні вагітності, виявило великі відхилення в розвитку плоду. Лікарі виявили численні відкладення кальцію в тканинах мозку, а також серйозне уповільнення зростання голови. Ембріон постраждав від важкої форми мікроцефалії, і пацієнтка вирішила перервати вагітність. Оскільки клінічна картина нагадувала наслідки вірусного захворювання, лікарі провели розтин витягнутого плоду. Гістологічний аналіз виявив численні порушення в мозку, включаючи зупинку розвитку кори головного мозку. Електронна мікроскопія і ПЛР-аналіз показали, що в нейронах знаходилися великі скупчення віріонів, а також вірусної РНК. Дослідники зуміли виділити повний геном вірусу і провели філогенетичний аналіз, який показав, що винуватцем захворювання був штам вірусу Зіка, схожий на той, що був виділений в 2013 році у жителя Французької Полінезії. Виявлення вірусу в мозку ураженого мікроцефалією ембріона стало першим переконливим свідченням на користь того, що вірус Зіка здатний проникнути в мозок дитини під час вагітності матері і викликати важкі відхилення розвитку плоду. Вірус Зіка викликає помірне підвищення температури, висип, біль у м'язах і кон'юнктивіт, які тривають до 7 днів. Вчені вважають, що особливу небезпеку лихоманка Зіка становить для вагітних жінок, викликаючи у їхніх дітей мікроцефалію - вроджене недорозвиток мозку і черепної коробки. Однак прямий зв'язок між вірусом Зіка і мікроцефалією поки не був науково доведений.